先观察后动手
当气相色谱仪出现故障时，不要急于动手。首先要回顾和审视以往的情况，查阅过去的维修记录，判断保留时间是否有改变；基线漂移和噪声跟以往有何不同；峰形有没有改变等，然后再着手去排除故障。
先外部后内部
故障究竟发生在仪器的内部还是外部，一般的检查方法是先外部后内部。
外部检查主要包括如下内容：
1.载气和各种辅助气体它们的压力、流速和载气线速度是否正常；
2.色谱柱、进样器、检测器以及传输管线的温度指示值是否正常；
3.气体管线和过滤器是否清洁干净，吸附剂是否饱和，有没有泄漏；
4.进样器及连接管线的消耗品 隔垫、O形圈、垫片和密封圈是否损坏，漏气和吸附。
5.注射器和进样阀操作是否规范，有无泄漏，针的尖锐程度和干净性；
6.样品的完整性浓度、存储器和存储时间是否有变化；
7.数据处理机连接和设定值是否合适。
开机内部检查主要包括如下内容：
1.机内电源指示灯、电子管或其他发光元件是否通电发亮；
2.有无高压打火、放电、冒烟现象；
3.机内有无特殊气味，如变压器电阻等因绝缘层烧坏而发出的焦煳味。
先整体后局部
气相色谱仪是一个完整的分析系统，主要包括五个部分：载气系统、进样系统、色谱柱、检测器和数据处理系统。其中任何一部分的不正常都会引起故障的发生，所以要观察整台仪器的现象，大致估计问题出在哪一部分。
如无法估计，则可采用分段检查，如怀疑某一部分不正常，可从大段到小段步步压缩，迅速而准确地判断故障出在哪个环节。
