1.水质监测中的应用
在环境污染中，水污染问题一直是严重问题，其中在地表水和地下水中常见的毒性污染物主要是硝基苯类化合物。这种化合物在生产中因为转化不彻底会残留下来，其危害性也比较大。在对此类化合物的监测中，在线气相色谱仪技术是常用有效的方法。
在应用前，要使用苯类化合物来作为萃取溶剂，但这种化合物是具有致癌性的，很容易产生二次污染。在水源中氯苯化合物比较常见，使用强极性毛细管柱可以实现高灵敏度的分离，并有效、精确测出污染物含量，使其满足环境排放要求和使用要求。并且利用气相色谱仪技术可以监测水体中重金属，其重现性好且精度高。
2.空气和废气监测应用
在社会工业生产中，会将一些挥发性有机物分散在空中，会对自然环境和人体健康产生严重影响。在使用气相色谱仪技术进行监测时，通常会使用石油醚进行解析，并使用外标法定量、定性，以满足大气监测的要求。而气相色谱仪检测仪器的应用，具备高灵敏度和抗干扰能力强的优点，可以有效降低检测工作的误差出现几率。
3.土壤残留农药监测应用分析
农业在我国的地位可想而知，生产过程中，农药的需求量也是比较大的，对人体的危害也很厉害，因此要对其监测重视起来。采用在线气相色谱仪对残留农药进行检测分析时，可以厚液膜大口径毛细管柱作为其分析柱，在预处理条件构建合理的情况下，可以实现对多组分有机磷农药进行准确分析。
